DRFZ Berlin

Selected Publications

Technical developments to promote high quality mass cytometry data

• Schulz, A. R., S. Baumgart, J. Schulze, M. Urbicht, A. Grutzkau and H. E. Mei (2019). “Stabilizing Antibody Cocktails for Mass Cytometry.” Cytometry A 95(8): 910-916.
• Schulz, A. R. and H. E. Mei (2019). “Surface Barcoding of Live PBMC for Multiplexed Mass Cytometry.” Methods Mol Biol 1989: 93-108.
• Schulz, A. R., S. Stanislawiak, S. Baumgart, A. Grutzkau and H. E. Mei (2017). “Silver nanoparticles for the detection of cell surface antigens in mass cytometry.” Cytometry A 91(1): 25-33.
• Baumgart, S., A. Peddinghaus, U. Schulte-Wrede, H. E. Mei and A. Grutzkau (2017). “OMIP-034: Comprehensive immune phenotyping of human peripheral leukocytes by mass cytometry for monitoring immunomodulatory therapies.” Cytometry A 91(1): 34-38.
• Baumgart, S., A. R. Schulz, A. Peddinghaus, S. Stanislawiak, S. Gillert, H. Hirseland, S. Krauthauser, C. Dose, H. E. Mei and A. Grutzkau (2017). “Dual-labelled antibodies for flow and mass cytometry: A new tool for cross-platform comparison and enrichment of target cells for mass cytometry.” Eur J Immunol 47(8): 1377-1385.
• Bringeland, G. H., L. Bader, N. Blaser, L. Budzinski, A. R. Schulz, H. E. Mei, K. M. Myhr, C. A. Vedeler and S. Gavasso (2019). “Optimization of Receptor Occupancy Assays in Mass Cytometry: Standardization Across Channels with QSC Beads.” Cytometry A 95(3): 314-322.
• Budzinski, L., A. R. Schulz, S. Baumgart, T. Burns, T. Rose, H. Hirseland and H. E. Mei (2019). “Osmium-Labeled Microspheres for Bead-Based Assays in Mass Cytometry.” J Immunol 202(10): 3103-3112.
• Lopez-Serrano Oliver, A., A. Haase, A. Peddinghaus, D. Wittke, N. Jakubowski, A. Luch, A. Grutzkau and S. Baumgart (2019). “Mass Cytometry Enabling Absolute and Fast Quantification of Silver Nanoparticle Uptake at the Single Cell Level.” Anal Chem 91(18): 11514-11519.

Applications of mass cytometry and collaborative works

• Ostendorf, L., M. Burns, P. Durek, G. A. Heinz, F. Heinrich, P. Garantziotis, P. Enghard, U. Richter, R. Biesen, U. Schneider, F. Knebel, G. Burmester, A. Radbruch, H. E. Mei, M. F. Mashreghi, F. Hiepe and T. Alexander (2020). “Targeting CD38 with Daratumumab in Refractory Systemic Lupus Erythematosus.” N Engl J Med 383(12): 1149-1155.
• Romero-Olmedo, A. J.*, A. R. Schulz*, M. Huber, C. U. Brehm, H. D. Chang, C. M. Chiarolla, T. Bopp, C. Skevaki, F. Berberich-Siebelt, A. Radbruch, H. E. Mei* and M. Lohoff* (2021). “Deep phenotypical characterization of human CD3(+) CD56(+) T cells by mass cytometry.” Eur J Immunol 51(3): 672-681. * Shared first and senior authors
• Yordanova, I. A., F. Ebner, A. R. Schulz, S. Steinfelder, B. Rosche, A. Bolze, F. Paul, H. E. Mei and S. Hartmann (2021). “The Worm-Specific Immune Response in Multiple Sclerosis Patients Receiving Controlled Trichuris suis Ova Immunotherapy.” Life (Basel) 11(2).
• Bertolo, M., S. Baumgart, P. Durek, A. Peddinghaus, H. Mei, T. Rose, P. Enghard and A. Grutzkau (2020). “Deep Phenotyping of Urinary Leukocytes by Mass Cytometry Reveals a Leukocyte Signature for Early and Non-Invasive Prediction of Response to Treatment in Active Lupus Nephritis.” Front Immunol 11: 256.
• Burns, M. *, L. Ostendorf*, R. Biesen, A. Grutzkau, F. Hiepe, H. E. Mei* and T. Alexander* (2021). “Dysregulated CD38 Expression on Peripheral Blood Immune Cell Subsets in SLE.” Int J Mol Sci 22(5). *Shared first and senior authors
• Pfister, D., N. G. Nunez, R. Pinyol, O. Govaere, M. Pinter, M. Szydlowska, R. Gupta, M. Qiu, A. Deczkowska, A. Weiner, F. Muller, A. Sinha, E. Friebel, T. Engleitner, D. Lenggenhager, A. Moncsek, D. Heide, K. Stirm, J. Kosla, E. Kotsiliti, V. Leone, M. Dudek, S. Yousuf, D. Inverso, I. Singh, A. Teijeiro, F. Castet, C. Montironi, P. K. Haber, D. Tiniakos, P. Bedossa, S. Cockell, R. Younes, M. Vacca, F. Marra, J. M. Schattenberg, M. Allison, E. Bugianesi, V. Ratziu, T. Pressiani, A. D’Alessio, N. Personeni, L. Rimassa, A. K. Daly, B. Scheiner, K. Pomej, M. M. Kirstein, A. Vogel, M. Peck-Radosavljevic, F. Hucke, F. Finkelmeier, O. Waidmann, J. Trojan, K. Schulze, H. Wege, S. Koch, A. Weinmann, M. Bueter, F. Rossler, A. Siebenhuner, S. De Dosso, J. P. Mallm, V. Umansky, M. Jugold, T. Luedde, A. Schietinger, P. Schirmacher, B. Emu, H. G. Augustin, A. Billeter, B. Muller-Stich, H. Kikuchi, D. G. Duda, F. Kutting, D. T. Waldschmidt, M. P. Ebert, N. Rahbari, H. E. Mei, A. R. Schulz, M. Ringelhan, N. Malek, S. Spahn, M. Bitzer, M. Ruiz de Galarreta, A. Lujambio, J. F. Dufour, T. U. Marron, A. Kaseb, M. Kudo, Y. H. Huang, N. Djouder, K. Wolter, L. Zender, P. N. Marche, T. Decaens, D. J. Pinato, R. Rad, J. C. Mertens, A. Weber, K. Unger, F. Meissner, S. Roth, Z. M. Jilkova, M. Claassen, Q. M. Anstee, I. Amit, P. Knolle, B. Becher, J. M. Llovet and M. Heikenwalder (2021). “NASH limits anti-tumour surveillance in immunotherapy-treated HCC.” Nature 592(7854): 450-456.
• Bottcher, C., C. Fernandez-Zapata, S. Schlickeiser, D. Kunkel, A. R. Schulz, H. E. Mei, C. Weidinger, R. M. Giess, S. Asseyer, B. Siegmund, F. Paul, K. Ruprecht and J. Priller (2019). “Multi-parameter immune profiling of peripheral blood mononuclear cells by multiplexed single-cell mass cytometry in patients with early multiple sclerosis.” Sci Rep 9(1): 19471.
• Bottcher, C., S. Schlickeiser, M. A. M. Sneeboer, D. Kunkel, A. Knop, E. Paza, P. Fidzinski, L. Kraus, G. J. L. Snijders, R. S. Kahn, A. R. Schulz, H. E. Mei, N. B. B. Psy, E. M. Hol, B. Siegmund, R. Glauben, E. J. Spruth, L. D. de Witte and J. Priller (2019). “Human microglia regional heterogeneity and phenotypes determined by multiplexed single-cell mass cytometry.” Nat Neurosci 22(1): 78-90. **
• Schulien, I., J. Kemming, V. Oberhardt, K. Wild, L. M. Seidel, S. Killmer, Sagar, F. Daul, M. Salvat Lago, A. Decker, H. Luxenburger, B. Binder, D. Bettinger, O. Sogukpinar, S. Rieg, M. Panning, D. Huzly, M. Schwemmle, G. Kochs, C. F. Waller, A. Nieters, D. Duerschmied, F. Emmerich, H. E. Mei, A. R. Schulz, S. Llewellyn-Lacey, D. A. Price, T. Boettler, B. Bengsch, R. Thimme, M. Hofmann and C. Neumann-Haefelin (2021). “Characterization of pre-existing and induced SARS-CoV-2-specific CD8(+) T cells.” Nat Med 27(1): 78-85.
• Schulte-Schrepping, J.*, N. Reusch*, D. Paclik*, K. Bassler*, S. Schlickeiser*, B. Zhang*, B. Kramer*, T. Krammer*, S. Brumhard*, L. Bonaguro*, E. De Domenico*, D. Wendisch*, M. Grasshoff, T. S. Kapellos, M. Beckstette, T. Pecht, A. Saglam, O. Dietrich, H. E. Mei, A. R. Schulz, C. Conrad, D. Kunkel, E. Vafadarnejad, C. J. Xu, A. Horne, M. Herbert, A. Drews, C. Thibeault, M. Pfeiffer, S. Hippenstiel, A. Hocke, H. Muller-Redetzky, K. M. Heim, F. Machleidt, A. Uhrig, L. Bosquillon de Jarcy, L. Jurgens, M. Stegemann, C. R. Glosenkamp, H. D. Volk, C. Goffinet, M. Landthaler, E. Wyler, P. Georg, M. Schneider, C. Dang-Heine, N. Neuwinger, K. Kappert, R. Tauber, V. Corman, J. Raabe, K. M. Kaiser, M. T. Vinh, G. Rieke, C. Meisel, T. Ulas, M. Becker, R. Geffers, M. Witzenrath, C. Drosten, N. Suttorp, C. von Kalle, F. Kurth, K. Handler, J. L. Schultze, A. C*. Aschenbrenner, Y*. Li*, J. Nattermann*, B. Sawitzki*, A. E. Saliba*, L. E. Sander* and C.-O. I. Deutsche (2020). “Severe COVID-19 Is Marked by a Dysregulated Myeloid Cell Compartment.” Cell,  doi 10.1016/j.cell.2020.08.001
• Burns, M., A. R. Schulz, D. Kunkel, M. Honig, S. Warth, B. Bengsch, T. Burns, J. Reinhardt, A. Grutzkau, M. L. Yaspo, J. Sodenkamp, U. Hoffmann and H. E. Mei (2020). “Mass Cytometry-A Tool for the Curious: Networking in Berlin.” Cytometry A 97(8): 764-767.
• Maity, P. C., M. Bilal, M. T. Koning, M. Young, C. A. M. van Bergen, V. Renna, A. Nicolo, M. Datta, E. Gentner-Gobel, R. S. Barendse, S. F. Somers, R. A. L. de Groen, J. S. P. Vermaat, D. Steinbrecher, C. Schneider, E. Tausch, T. Bittolo, R. Bomben, A. N. Mazzarello, G. Del Poeta, W. G. M. Kroes, J. T. van Wezel, K. Imkeller, C. E. Busse, M. Degano, T. Bakchoul, A. R. Schulz, H. Mei, P. Ghia, K. Kotta, K. Stamatopoulos, H. Wardemann, A. Zucchetto, N. Chiorazzi, V. Gattei, S. Stilgenbauer, H. Veelken and H. Jumaa (2020). “IGLV3-21*01 is an inherited risk factor for CLL through the acquisition of a single-point mutation enabling autonomous BCR signaling.” Proc Natl Acad Sci U S A 117(8): 4320-4327.
• Cossarizza, A., H. D. Chang, A. Radbruch, A. Acs, D. Adam, S. Adam-Klages, W. W. Agace, N. Aghaeepour, M. Akdis, M. Allez, L. N. Almeida, G. Alvisi, G. Anderson, I. Andra, F. Annunziato, A. Anselmo, P. Bacher, C. T. Baldari, S. Bari, V. Barnaba, J. Barros-Martins, L. Battistini, W. Bauer, S. Baumgart, N. Baumgarth, D. Baumjohann, B. Baying, M. Bebawy, B. Becher, W. Beisker, V. Benes, R. Beyaert, A. Blanco, D. A. Boardman, C. Bogdan, J. G. Borger, G. Borsellino, P. E. Boulais, J. A. Bradford, D. Brenner, R. R. Brinkman, A. E. S. Brooks, D. H. Busch, M. Buscher, T. P. Bushnell, F. Calzetti, G. Cameron, I. Cammarata, X. Cao, S. L. Cardell, S. Casola, M. A. Cassatella, A. Cavani, A. Celada, L. Chatenoud, P. K. Chattopadhyay, S. Chow, E. Christakou, L. Cicin-Sain, M. Clerici, F. S. Colombo, L. Cook, A. Cooke, A. M. Cooper, A. J. Corbett, A. Cosma, L. Cosmi, P. G. Coulie, A. Cumano, L. Cvetkovic, V. D. Dang, C. Dang-Heine, M. S. Davey, D. Davies, S. De Biasi, G. Del Zotto, G. V. Dela Cruz, M. Delacher, S. Della Bella, P. Dellabona, G. Deniz, M. Dessing, J. P. Di Santo, A. Diefenbach, F. Dieli, A. Dolf, T. Dorner, R. J. Dress, D. Dudziak, M. Dustin, C. A. Dutertre, F. Ebner, S. B. G. Eckle, M. Edinger, P. Eede, G. R. A. Ehrhardt, M. Eich, P. Engel, B. Engelhardt, A. Erdei, C. Esser, B. Everts, M. Evrard, C. S. Falk, T. A. Fehniger, M. Felipo-Benavent, H. Ferry, M. Feuerer, A. Filby, K. Filkor, S. Fillatreau, M. Follo, I. Forster, J. Foster, G. A. Foulds, B. Frehse, P. S. Frenette, S. Frischbutter, W. Fritzsche, D. W. Galbraith, A. Gangaev, N. Garbi, B. Gaudilliere, R. T. Gazzinelli, J. Geginat, W. Gerner, N. A. Gherardin, K. Ghoreschi, L. Gibellini, F. Ginhoux, K. Goda, D. I. Godfrey, C. Goettlinger, J. M. Gonzalez-Navajas, C. S. Goodyear, A. Gori, J. L. Grogan, D. Grummitt, A. Grutzkau, C. Haftmann, J. Hahn, H. Hammad, G. Hammerling, L. Hansmann, G. Hansson, C. M. Harpur, S. Hartmann, A. Hauser, A. E. Hauser, D. L. Haviland, D. Hedley, D. C. Hernandez, G. Herrera, M. Herrmann, C. Hess, T. Hofer, P. Hoffmann, K. Hogquist, T. Holland, T. Hollt, R. Holmdahl, P. Hombrink, J. P. Houston, B. F. Hoyer, B. Huang, F. P. Huang, J. E. Huber, J. Huehn, M. Hundemer, C. A. Hunter, W. Y. K. Hwang, A. Iannone, F. Ingelfinger, S. M. Ivison, H. M. Jack, P. K. Jani, B. Javega, S. Jonjic, T. Kaiser, T. Kalina, T. Kamradt, S. H. E. Kaufmann, B. Keller, S. L. C. Ketelaars, A. Khalilnezhad, S. Khan, J. Kisielow, P. Klenerman, J. Knopf, H. F. Koay, K. Kobow, J. K. Kolls, W. T. Kong, M. Kopf, T. Korn, K. Kriegsmann, H. Kristyanto, T. Kroneis, A. Krueger, J. Kuhne, C. Kukat, D. Kunkel, H. Kunze-Schumacher, T. Kurosaki, C. Kurts, P. Kvistborg, I. Kwok, J. Landry, O. Lantz, P. Lanuti, F. LaRosa, A. Lehuen, S. LeibundGut-Landmann, M. D. Leipold, L. Y. T. Leung, M. K. Levings, A. C. Lino, F. Liotta, V. Litwin, Y. Liu, H. G. Ljunggren, M. Lohoff, G. Lombardi, L. Lopez, M. Lopez-Botet, A. E. Lovett-Racke, E. Lubberts, H. Luche, B. Ludewig, E. Lugli, S. Lunemann, H. T. Maecker, L. Maggi, O. Maguire, F. Mair, K. H. Mair, A. Mantovani, R. A. Manz, A. J. Marshall, A. Martinez-Romero, G. Martrus, I. Marventano, W. Maslinski, G. Matarese, A. V. Mattioli, C. Maueroder, A. Mazzoni, J. McCluskey, M. McGrath, H. M. McGuire, I. B. McInnes, H. E. Mei, F. Melchers, S. Melzer, D. Mielenz, S. D. Miller, K. H. G. Mills, H. Minderman, J. Mjosberg, J. Moore, B. Moran, L. Moretta, T. R. Mosmann, S. Muller, G. Multhoff, L. E. Munoz, C. Munz, T. Nakayama, M. Nasi, K. Neumann, L. G. Ng, A. Niedobitek, S. Nourshargh, G. Nunez, J. E. O’Connor, A. Ochel, A. Oja, D. Ordonez, A. Orfao, E. Orlowski-Oliver, W. Ouyang, A. Oxenius, R. Palankar, I. Panse, K. Pattanapanyasat, M. Paulsen, D. Pavlinic, L. Penter, P. Peterson, C. Peth, J. Petriz, F. Piancone, W. F. Pickl, S. Piconese, M. Pinti, A. G. Pockley, M. J. Podolska, Z. Poon, K. Pracht, I. Prinz, C. E. M. Pucillo, S. A. Quataert, L. Quatrini, K. M. Quinn, H. Radbruch, T. Radstake, S. Rahmig, H. P. Rahn, B. Rajwa, G. Ravichandran, Y. Raz, J. A. Rebhahn, D. Recktenwald, D. Reimer, C. Reis e Sousa, E. B. M. Remmerswaal, L. Richter, L. G. Rico, A. Riddell, A. M. Rieger, J. P. Robinson, C. Romagnani, A. Rubartelli, J. Ruland, A. Saalmuller, Y. Saeys, T. Saito, S. Sakaguchi, F. Sala-de-Oyanguren, Y. Samstag, S. Sanderson, I. Sandrock, A. Santoni, R. B. Sanz, M. Saresella, C. Sautes-Fridman, B. Sawitzki, L. Schadt, A. Scheffold, H. U. Scherer, M. Schiemann, F. A. Schildberg, E. Schimisky, A. Schlitzer, J. Schlosser, S. Schmid, S. Schmitt, K. Schober, D. Schraivogel, W. Schuh, T. Schuler, R. Schulte, A. R. Schulz, S. R. Schulz, C. Scotta, D. Scott-Algara, D. P. Sester, T. V. Shankey, B. Silva-Santos, A. K. Simon, K. M. Sitnik, S. Sozzani, D. E. Speiser, J. Spidlen, A. Stahlberg, A. M. Stall, N. Stanley, R. Stark, C. Stehle, T. Steinmetz, H. Stockinger, Y. Takahama, K. Takeda, L. Tan, A. Tarnok, G. Tiegs, G. Toldi, J. Tornack, E. Traggiai, M. Trebak, T. I. M. Tree, J. Trotter, J. Trowsdale, M. Tsoumakidou, H. Ulrich, S. Urbanczyk, W. van de Veen, M. van den Broek, E. van der Pol, S. Van Gassen, G. Van Isterdael, R. A. W. van Lier, M. Veldhoen, S. Vento-Asturias, P. Vieira, D. Voehringer, H. D. Volk, A. von Borstel, K. von Volkmann, A. Waisman, R. V. Walker, P. K. Wallace, S. A. Wang, X. M. Wang, M. D. Ward, K. A. Ward-Hartstonge, K. Warnatz, G. Warnes, S. Warth, C. Waskow, J. V. Watson, C. Watzl, L. Wegener, T. Weisenburger, A. Wiedemann, J. Wienands, A. Wilharm, R. J. Wilkinson, G. Willimsky, J. B. Wing, R. Winkelmann, T. H. Winkler, O. F. Wirz, A. Wong, P. Wurst, J. H. M. Yang, J. Yang, M. Yazdanbakhsh, L. Yu, A. Yue, H. Zhang, Y. Zhao, S. M. Ziegler, C. Zielinski, J. Zimmermann and A. Zychlinsky (2019). “Guidelines for the use of flow cytometry and cell sorting in immunological studies (second edition).” Eur J Immunol 49(10): 1457-1973.
• Cossarizza, A., H. D. Chang, A. Radbruch, M. Akdis, I. Andra, F. Annunziato, P. Bacher, V. Barnaba, L. Battistini, W. M. Bauer, S. Baumgart, B. Becher, W. Beisker, C. Berek, A. Blanco, G. Borsellino, P. E. Boulais, R. R. Brinkman, M. Buscher, D. H. Busch, T. P. Bushnell, X. Cao, A. Cavani, P. K. Chattopadhyay, Q. Cheng, S. Chow, M. Clerici, A. Cooke, A. Cosma, L. Cosmi, A. Cumano, V. D. Dang, D. Davies, S. De Biasi, G. Del Zotto, S. Della Bella, P. Dellabona, G. Deniz, M. Dessing, A. Diefenbach, J. Di Santo, F. Dieli, A. Dolf, V. S. Donnenberg, T. Dorner, G. R. A. Ehrhardt, E. Endl, P. Engel, B. Engelhardt, C. Esser, B. Everts, A. Dreher, C. S. Falk, T. A. Fehniger, A. Filby, S. Fillatreau, M. Follo, I. Forster, J. Foster, G. A. Foulds, P. S. Frenette, D. Galbraith, N. Garbi, M. D. Garcia-Godoy, J. Geginat, K. Ghoreschi, L. Gibellini, C. Goettlinger, C. S. Goodyear, A. Gori, J. Grogan, M. Gross, A. Grutzkau, D. Grummitt, J. Hahn, Q. Hammer, A. E. Hauser, D. L. Haviland, D. Hedley, G. Herrera, M. Herrmann, F. Hiepe, T. Holland, P. Hombrink, J. P. Houston, B. F. Hoyer, B. Huang, C. A. Hunter, A. Iannone, H. M. Jack, B. Javega, S. Jonjic, K. Juelke, S. Jung, T. Kaiser, T. Kalina, B. Keller, S. Khan, D. Kienhofer, T. Kroneis, D. Kunkel, C. Kurts, P. Kvistborg, J. Lannigan, O. Lantz, A. Larbi, S. LeibundGut-Landmann, M. D. Leipold, M. K. Levings, V. Litwin, Y. Liu, M. Lohoff, G. Lombardi, L. Lopez, A. Lovett-Racke, E. Lubberts, B. Ludewig, E. Lugli, H. T. Maecker, G. Martrus, G. Matarese, C. Maueroder, M. McGrath, I. McInnes, H. E. Mei, F. Melchers, S. Melzer, D. Mielenz, K. Mills, D. Mirrer, J. Mjosberg, J. Moore, B. Moran, A. Moretta, L. Moretta, T. R. Mosmann, S. Muller, W. Muller, C. Munz, G. Multhoff, L. E. Munoz, K. M. Murphy, T. Nakayama, M. Nasi, C. Neudorfl, J. Nolan, S. Nourshargh, J. E. O’Connor, W. Ouyang, A. Oxenius, R. Palankar, I. Panse, P. Peterson, C. Peth, J. Petriz, D. Philips, W. Pickl, S. Piconese, M. Pinti, A. G. Pockley, M. J. Podolska, C. Pucillo, S. A. Quataert, T. Radstake, B. Rajwa, J. A. Rebhahn, D. Recktenwald, E. B. M. Remmerswaal, K. Rezvani, L. G. Rico, J. P. Robinson, C. Romagnani, A. Rubartelli, B. Ruckert, J. Ruland, S. Sakaguchi, F. Sala-de-Oyanguren, Y. Samstag, S. Sanderson, B. Sawitzki, A. Scheffold, M. Schiemann, F. Schildberg, E. Schimisky, S. A. Schmid, S. Schmitt, K. Schober, T. Schuler, A. R. Schulz, T. Schumacher, C. Scotta, T. V. Shankey, A. Shemer, A. K. Simon, J. Spidlen, A. M. Stall, R. Stark, C. Stehle, M. Stein, T. Steinmetz, H. Stockinger, Y. Takahama, A. Tarnok, Z. Tian, G. Toldi, J. Tornack, E. Traggiai, J. Trotter, H. Ulrich, M. van der Braber, R. A. W. van Lier, M. Veldhoen, S. Vento-Asturias, P. Vieira, D. Voehringer, H. D. Volk, K. von Volkmann, A. Waisman, R. Walker, M. D. Ward, K. Warnatz, S. Warth, J. V. Watson, C. Watzl, L. Wegener, A. Wiedemann, J. Wienands, G. Willimsky, J. Wing, P. Wurst, L. Yu, A. Yue, Q. Zhang, Y. Zhao, S. Ziegler and J. Zimmermann (2017). “Guidelines for the use of flow cytometry and cell sorting in immunological studies.” Eur J Immunol 47(10): 1584-1797.